V2AS
问路
意见反馈
↓ 按住下拉
Win64 驱动内核编程-28.枚举消息钩子
枚举消息钩子 简单粘贴点百度的解释,科普下消息钩子: 钩子是WINDOWS中消息处理机制的一个要点,通过安装各种钩子,应用程序能够设置相应的子例程来监视系统里的消 ......
Hook
return
WH
NULL
PVOID
【
Plink
】Error: Multiple instances of '_' in sample ID.?
目录 前言 原因 解决方法 方法一:修改样本名 方法二:修改--id-delim 方法三:加入--double_id或--const-fid参数 前言 将vcf转化为
plink
格式时,命令如下:
plink
- ......
id
vcf
Error
sample
ID
GWAS与GS模型介绍与比较
目录 1.GWAS模型 1.1卡方检验 1.2 相关性系数的t检验 1.3 一般线性模型GLM 1.4 混合线性模型MLM 1.5 压缩混合线性模型CMLM 1.6 SUPER 1.7 FarmCPU 1.8 Blink 2.G ......
模型
IO
GWAS
SNP
GS
plink
进行PCA分析
当我们进行群体遗传分析时,得到vcf后,可利用
plink
进行主成分(PCA)分析; 1 conda install
plink
第一步:将vcf转换为
plink
格式 1
plink
--vcf F_M_trans.reco ......
PCA
plink
分析
testacc
vcf
利用
plink
软件基于LD信息过滤SNP
最近有需求,对WGS测序获得SNP信息进行筛减,可问题是测序个体少,call rate,maf,hwe,等条件过滤后,snp数量还是千万级别,所以后面利用
plink
工具根据LD信息来滤除大 ......
indep
vcf
kb
plink
利用
如何识别自己基因组数据是哪个全基因组参考版本(Genome Reference Versions/ Genome Build)
首先在这里先感谢我们【Bio生信学习交流群】的群友和创建此群的群主【陈博士后】。 今天解决的问题是怎么查看自己的基因组数据是哪个Genome Reference Versions。 步骤 ......
基因组
测序
Genome
GWAS
adsbygoogle
Eigensoft-smartpca分析PCA报错:warning (mapfile): bad chrom: Segmentation fault
目录 问题 解决 问题 一直以来用Eigensoft的smartpca来做群体遗传的PCA分析很顺畅,结果也比较靠谱。 但今天报错如下: $ ~/miniconda3/bin/smartpca -p smartpca. ......
报错
warning
chrom
mapfile
bad
xhell、xftp、putty使用教程
作为远程登陆工具,上传代码登陆服务器工具 1、XSHELL Xshell是远程连接Linux服务器的工具,基于SSH协议,使用它可以更加方便的操作Linux操作系统,在刚使用时可能需 ......
PuTTY
SSH
putty
教程
使用
如何从vcf文件中批量提取一系列基因的SNP位点?
目录 需求 示例文件 代码实现 补充说明 需求 客户的一个简单需求: 我有一批功能基因位点,想从重测序的群体材料中找到这些位点,如何批量快速获得? 示例文件 gene ......
vcf
文件
vcftools
test
txt
admixture 群体结构分析
tructure是与PCA、进化树相似的方法,就是利用分子标记的基因型信息对一组样本进行分类,分子标记可以是SNP、indel、SSR。相比于PCA,进化树,群体结构分析可明确各个群 ......
SNP
plink
群体
vcf
测序
V2AS = Way To Ask
V2AS 一个技术分享与创造的静土
手机扫一扫
移动阅读更方便
近15日热搜文章
解决Avalonia 11.X版本的中文字体问题
一文读懂PRBS定义、生成办法、作用
uniapp开发H5,分享链接到微信好友,显示标题和缩略图
4
CANoe学习笔记(三):CANoe的诊断功能和cdd文件
5
CANoe学习笔记(六):如何实现LIN和CAN的多帧传输-----LIN
6
Android 显示手机电池的当前电量
7
2019-7-3-WPF-使用-Composition-API-做高性能渲染
8
BootstrapBlazor实战 Menu 导航菜单使用(1)
9
ws请求定时
10
《HelloGitHub》第 75 期