V2AS问路

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  • Win64 驱动内核编程-28.枚举消息钩子
    枚举消息钩子 简单粘贴点百度的解释,科普下消息钩子: 钩子是WINDOWS中消息处理机制的一个要点,通过安装各种钩子,应用程序能够设置相应的子例程来监视系统里的消 ......
  • HookreturnWHNULLPVOID
  • 【Plink】Error: Multiple instances of '_' in sample ID.?
    目录 前言 原因 解决方法 方法一:修改样本名 方法二:修改--id-delim 方法三:加入--double_id或--const-fid参数 前言 将vcf转化为plink格式时,命令如下: plink - ......
  • idvcfErrorsampleID
  • GWAS与GS模型介绍与比较
    目录 1.GWAS模型 1.1卡方检验 1.2 相关性系数的t检验 1.3 一般线性模型GLM 1.4 混合线性模型MLM 1.5 压缩混合线性模型CMLM 1.6 SUPER 1.7 FarmCPU 1.8 Blink 2.G ......
  • 模型IOGWASSNPGS
  • plink 进行PCA分析
    当我们进行群体遗传分析时,得到vcf后,可利用plink进行主成分(PCA)分析; 1 conda install plink 第一步:将vcf转换为plink格式 1 plink --vcf F_M_trans.reco ......
  • PCAplink分析testaccvcf
  • 利用plink软件基于LD信息过滤SNP
    最近有需求,对WGS测序获得SNP信息进行筛减,可问题是测序个体少,call rate,maf,hwe,等条件过滤后,snp数量还是千万级别,所以后面利用plink工具根据LD信息来滤除大 ......
  • indepvcfkbplink利用
  • 如何识别自己基因组数据是哪个全基因组参考版本(Genome Reference Versions/ Genome Build)
    首先在这里先感谢我们【Bio生信学习交流群】的群友和创建此群的群主【陈博士后】。 今天解决的问题是怎么查看自己的基因组数据是哪个Genome Reference Versions。 步骤 ......
  • 基因组测序GenomeGWASadsbygoogle
  • Eigensoft-smartpca分析PCA报错:warning (mapfile): bad chrom: Segmentation fault
    目录 问题 解决 问题 一直以来用Eigensoft的smartpca来做群体遗传的PCA分析很顺畅,结果也比较靠谱。 但今天报错如下: $ ~/miniconda3/bin/smartpca -p smartpca. ......
  • 报错warningchrommapfilebad
  • xhell、xftp、putty使用教程
    作为远程登陆工具,上传代码登陆服务器工具 1、XSHELL Xshell是远程连接Linux服务器的工具,基于SSH协议,使用它可以更加方便的操作Linux操作系统,在刚使用时可能需 ......
  • PuTTYSSHputty教程使用
  • 如何从vcf文件中批量提取一系列基因的SNP位点?
    目录 需求 示例文件 代码实现 补充说明 需求 客户的一个简单需求: 我有一批功能基因位点,想从重测序的群体材料中找到这些位点,如何批量快速获得? 示例文件 gene ......
  • vcf文件vcftoolstesttxt
  • admixture 群体结构分析
    tructure是与PCA、进化树相似的方法,就是利用分子标记的基因型信息对一组样本进行分类,分子标记可以是SNP、indel、SSR。相比于PCA,进化树,群体结构分析可明确各个群 ......
  • SNPplink群体vcf测序

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