利用plink软件基于LD信息过滤SNP
最近有需求，对WGS测序获得SNP信息进行筛减，可问题是测序个体少，call rate，maf，hwe，等条件过滤后，snp数量还是千万级别，所以后面利用plink工具根据LD信息来滤除大 ......![]()
admixture 群体结构分析
tructure是与PCA、进化树相似的方法，就是利用分子标记的基因型信息对一组样本进行分类，分子标记可以是SNP、indel、SSR。相比于PCA，进化树，群体结构分析可明确各个群 ......![]()
SNP 过滤（二）
本文转载于https://www.jianshu.com/p/e6d5dd774c6e SNP过滤有两种情况，一种是仅根据位点质量信息（测序深度，回帖质量等）对SNP进行粗过滤。如果使用GATK对重测序 ......SR4R数据库：水稻4个SNP集的筛选及其应用
目录 前言 四个SNP集 hapmapSNPs tagSNPs fixedSNPs barcodeSNPs hapmapSNPs的指标统计 tagSNPs的群体结构验证 tagSNPs的遗传多样性 tagSNPs用于GS fixedSNPs验 ......![]()
WinEdt && LaTex（四）—— 自定义新命令（newcommand、def）
使用如下的命令：\newcommand{name}[num]{definition}； 该命令（newcommand）有两个参数，第一个 name 是你想要建立的命令的名称，第二个definition是命令的定义，num是 ......Empowering Long-tail Item Recommendation through Cross Decoupling Network (CDN)
Empowering Long-tail Item Recommendation through Cross Decoupling Network (CDN) 来源： KDD'2023 Google Research 目录 Empowering Long-tail Item Recomme ......![]()
[Mathematics][MIT 18.02]Detailed discussions about 2-D and 3-D integral and their connections
Since it is just a sort of discussion, I will just give the formula and condition without proving them or leaving examples. General: $\int_{C}\ve ......从带Per-Building数据的KML/COLLADA中创建3D Tiles
Cesium中文网：http://cesiumcn.org/ | 国内快速访问：http://cesium.coinidea.com/ 许多Cesium的使用者经常需要将整个城市的数十万个三维建筑可视化，用于房地产、 ......![]()
AtCoder Regular Contest 99
传送门 C - Minimization 第一次可能有多种选择，我们枚举所有的选择，然后两边贪心取即可。 Code include <bits/stdc++.h> define MP make_pair define fi fir ......
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