【豆科基因组】绿豆Mungbean, Vigna radiata基因组2014NC
目录 来源 一、简介 二、结果 基因组组装 重复序列和转座子 基因组特征和基因注释 绿豆的驯化 豆科基因组复制历史 基于转录组分析的豇豆属形成 绿豆育种基因组资源 ......![]()
【豆科基因组】小豆（红豆）adzuki bean, Vigna angularis基因组2015
目录 一、来源 研究一：Draft genome sequence of adzuki bean, Vigna angularis 研究二：Genome sequencing of adzuki bean (Vigna angularis) provides insight i ......![]()
【豆科基因组】大豆(Soybean, Glycine max)泛基因组2020Cell
目录 一、前沿概述 二、主要结果 重测序、组装与注释 泛基因组 SV特征 PAV与古多倍化，WGD事件 基因SV与基因融合 SV与大豆驯化 SV影响基因表达及其与性状关联 一、前 ......![]()
【豆科基因组】豇豆Cowpea，Vigna unguiculata [L.] Walp.基因组2019PJ
目录 来源 结果 基因组大小估计 采用stitching方法组装 修改豇豆染色体编号 基因注释和重复DNA 豇豆遗传多样性 SNP和INDEL Vu03 上 4.2-Mb 染色体倒位的鉴定 与 ......![]()
Bedtools genomecov 计算覆盖度
简单说明： 从2.28.0版开始，bedtools使用htslib库支持CRAM格式 除了BAM文件，bedtools默认所有的输入文件都以TAB键分割 除非使用-sorted选项，bedtools默认不支持大 ......![]()
[MIT6.006] 1. Algorithmic Thinking, Peak Finding 算法思维，峰值寻找
[MIT6.006] 系列笔记将记录我观看《MIT6.006 Introduction to Algorithms, Fall 2011》的课程内容和一些自己补充扩展的知识点。该课程主要介绍了一些基础的算法，课 ......![]()
短序列组装Sequence Assembly（转载）
转载：http://blog.sina.com.cn/s/blog_4af3f0d20100fq5i.html 短序列组装（Sequence assembly）几乎是近年来next-generation sequencing最热门的话题。简单来说，就 ......![]()
【百奥云GS专栏】全基因组选择之模型篇
目录 1. 前言 2. BLUP方法 ABLUP GBLUP ssGBLUP RRBLUP 3. 贝叶斯方法 BayesA BayesB BayesC/Cπ/Dπ Bayesian Lasso 4. 机器学习 支持向量机 集成学习 深度学习 5 ......![]()
Bedtools如何比较两个参考基因组注释版本的基因？
目录 问题 思路 原问题来自：How to calculate overlapping genes between two genome annotation versions？ 其实可分为两个问题： 一是我组装了一个新的基因组， ......如何识别自己基因组数据是哪个全基因组参考版本（Genome Reference Versions/ Genome Build）
首先在这里先感谢我们【Bio生信学习交流群】的群友和创建此群的群主【陈博士后】。 今天解决的问题是怎么查看自己的基因组数据是哪个Genome Reference Versions。 步骤 ......![]()
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