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【宏蛋白组】iMetaLab平台分析肠道宏蛋白质组数据
目录 一、iMetaLab简介 二、内置工具与模块 1. Data Processing module 2. Functional Analysis 3. R Developing environment 4. R based data analysis packages ......
分析
蛋白
蛋白组
鉴定
iMetaLab
R语言|ggplot2| 绘制KEGG气泡图
在 RStudio 中使用 BiocManager 安装包 install.packages("BiocManager") install.packages("ggplot2") 安装对应版本的 Rtools 详细指导说明 安装连接 安装完成 ......
ggplot2
语言
绘制
KEGG
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[Pyhton] SimPy 离散事件模拟框架详解 —— 以一个简单的汽车充电排队模拟为例
目录 一、背景知识 二、SimPy 讲解 2.1 SimPy 概述 2.2 基本概念 2.3 一个汽车开开停停的例子 2.4 在走走停停过程中增加充电过程(过程交互) 2.5 共享资源 三、后续 ......
env
事件
SimPy
Start
模拟
Chapter 20 Treatment-Confounder Feedback
目录 20.1 The elements of treatment-confounder feedback 20.2 The bias of traditional methods 20.3 Why traditional methods fail 20.4 Why traditional me ......
Chapter
treatment
mathbb
20
feedback
[R] 如何绘制各样本的
pathway
丰度热图?
一般而言,我们做完
pathway
富集分析,就做下气泡图或bar图来进行展示,但它们实际上只考虑了富集因子和Pvalue。如果我们不关注这两个因素,而是在乎样本本身的
pathway
......
Pathway
热图
绘制
pathway
group
记录R的一些黑魔法
12345678
pathway
<-read.table("PTC+_transcript_pep_supp_KEGG.txt",header=T,sep="t",stringsAsFactors=FALSE)pp <- ggplot(
pathway
,aes(richFactor,
Pathway
......
scale
cols
g2
layout
function
R包对植物进行GO,KEGG注释
1、安装,加载所用到到R包 用BiocManager安装,可同时加载依赖包 source("https://bioconductor.org/biocLite.R") BiocManager::install("clusterProfiler") librar ......
GO
pathway
KEGG
BP
富集
【Pathview web】通路映射可视化
pathview是一个通路可视化友好的R包,最主要的是它支持多组学数据映射(基因/蛋白-代谢)。自己用过它的R包,后来发现有网页版的,果断介绍给学员。因为不常用,记录要点 ......
示例
映射
web
Linux
1.
QTP——改变Excel的单元格颜色
Public Function QTP_Change_Color(
pathway
,sheetname,x,y,color) Dim srcData,srcDoc,sp1,sp2,num,use,a1,a2,a3 set srcData = CreateObject("Ex ......
单元格
Excel
颜色
EXCEL
srcDoc
KEGG通路图应该怎么看(转载)
转载:http://www.omicshare.com/forum/thread-107-1-3219.html (出处: OmicShare Forum) 不管是RNA-seq的分析数据,还是蛋白组的分析数据,都有一个数据库我们会经 ......
通路
KEGG
com
https
pathway
V2AS = Way To Ask
V2AS 一个技术分享与创造的静土
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