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  • 【基因组注释】ncRNA注释
    目录 1. ncRNA 2. 软件 tRNA注释 rRNA注释 其他ncRNA注释 3. 注释 tRNA rRNA snRNA、miRNA等 4. snRNA、miRNA等结果的统计 1. ncRNA 非编码RNA(Non-coding RNA, n ......
  • el注释undeftRNAattributes
  • miRNA分析--比对(二)
    miRNA分析--数据过滤(一) 在比对之前为了减少比对时间,将每一个样本中的reads进行合并,得到fasta格式,其命名规则如下: 样本_r数子_x数字 r 中的数字表示reads序 ......
  • famiRNAtrm分析reads
  • miRNA预测工具miRDeep-P2
    之前讲过预测植物miRNA的一款软件miR-PREFER, 今天在介绍一款软件miRDeep-p2, 也叫miRDP2   在此之前,应安装一下软件   Bowite, Bowtie2, Vienna (RNA二级结构 ......
  • famiRNAreads预测bst
  • RNA
    原始地球 你会想,我们每一个细胞中都有一个遗传分子叫做DNA?那么,DNA之前有没有什么遗传分子呢?我的答案是:“有”。在远古地球,那个海底有无数火山,喷发的火山口两 ......
  • RNADNA测序NET转录
  • ctDNA|endosymbiosis
    5.10叶绿体基因组编码多种蛋白质和RNA 叶绿体和线粒体的共同点:叶绿体和线粒体的大小,功能(编码区)大体一致,但叶绿体拥有更多基因,所以在编码tRNA时,也有内含子 ......
  • ctDNA叶绿体DNAcfDNAadsbygoogle
  • reference-based measure|Distribution-based measure|密码子使用偏向性
    生命组学 密码子使用偏向性是指同义密码子使用频率不同。 影响因素:1.GC2.横向基因转移3.selection 转录偏好于多的tRNA。 同种氨基酸但有密码子使用偏向。 ======= ......
  • measurebasedViewPython密码子
  • mtDNA|ctDNA|cpDNA|
    5.9细胞器基因组是编码细胞器蛋白质的环状DNA分子 细胞器中除真核细胞线粒体DNA(mtDNA)是线性的外,都是环状分子,比如叶绿体DNA(ctDNA,cpDNA)。因为单个细胞器有几 ......
  • 基因组ctDNADNAmtDNA细胞器
  • Nature 重大发现:癌基因竟不在染色体上?第一作者吴思涵亲身解读!
    编辑|李丽 记者|布德鸟 图片提供|吴思涵 今日凌晨,美国加州大学圣地亚哥分校 Ludwig 癌症研究所的 Paul Mischel 教授领导的研究团队发现, 大量的癌基 ......
  • ecDNADNA癌基因肿瘤Nature
  • 【豆科基因组】小豆(红豆)adzuki bean, Vigna angularis基因组2015
    目录 一、来源 研究一:Draft genome sequence of adzuki bean, Vigna angularis 研究二:Genome sequencing of adzuki bean (Vigna angularis) provides insight i ......
  • 基因组基因小豆红豆测序
  • python版的MCScan绘图
    最近发现了python版的MCScan,是个大宝藏。由于走了不少弯路,终于画出美图,赶紧记录下来。 github地址 https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-ve ......
  • pythonbedsugarspinachscaffold

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