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  • 【基因组注释】ncRNA注释
    目录 1. ncRNA 2. 软件 tRNA注释 rRNA注释 其他ncRNA注释 3. 注释 tRNA rRNA snRNA、miRNA等 4. snRNA、miRNA等结果的统计 1. ncRNA 非编码RNA(Non-coding RNA, n ......
  • el注释undeftRNAattributes
  • miRNA 基本知识
    miRNA MicroRNA (miRNA)  是一类内生的、长度约为20-24个核苷酸的小 RNA,其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个 miRNA 可以有多个靶基因的表达,而几个 miRNA 也 ......
  • miRNAmicroRNAhttp异常C#
  • miRNA分析--比对(二)
    miRNA分析--数据过滤(一) 在比对之前为了减少比对时间,将每一个样本中的reads进行合并,得到fasta格式,其命名规则如下: 样本_r数子_x数字 r 中的数字表示reads序 ......
  • famiRNAtrm分析reads
  • 知识图谱-生物信息学-医学顶刊论文(Briefings in Bioinformatics-2021):生物信息学中的图表示学习:趋势、方法和应用
    4.(2021.6.24)Briefings-生物信息学中的图表示学习:趋势、方法和应用 论文标题: Graph representation learning in bioinformatics: trends, methods and applica ......
  • 嵌入学习节点方法表示
  • 易基因:PIWI/piRNA在人癌症中的表观遗传调控机制(DNA甲基化+m6A+组蛋白修饰)|综述
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 2023年03月07日,南华大学衡阳医学院李二毛团队在《Molecular Cancer》杂志发表了题为“The epigenet ......
  • piRNAPIWI甲基化DNA调控
  • miRNA预测工具miRDeep-P2
    之前讲过预测植物miRNA的一款软件miR-PREFER, 今天在介绍一款软件miRDeep-p2, 也叫miRDP2   在此之前,应安装一下软件   Bowite, Bowtie2, Vienna (RNA二级结构 ......
  • famiRNAreads预测bst
  • SNPEFF snp注释 (添加自己基因组)
    之间介绍过annovar进行对snp注释,今天介绍snpEFF SnpEff is a variant annotation and effect prediction tool. It annotates and predicts the effects of vari ......
  • 注释位点添加snpEffspinach
  • miRAN 分析以及mRNA分析
    一些参考资料 http://www.360doc.com/content/17/0528/22/19913717_658086490.shtml https://www.cnblogs.com/triple-y/p/9338890.html 一、对miRNA进行分析  1、b ......
  • 分析library源代码resdatatest
  • miRNA分析--靶基因预测(三)
    miRNA分析--数据过滤(一) miRNA分析--比对(二) 根据miRNA Target Prediction in Plants, miRNA并非所有区域都要求严格匹配,其中第1位碱基和第14位以后的碱基是允 ......
  • miRNA分析数据库代码adsbygoogle
  • miRNA分析--数据过滤(一)
    miRNA 数据过滤我使用cutadapt 1 cutadapt -a AGATCGGAAGAGCACACGTCT -m 15 -q 20 --discard-untrimmed -o outname .fa --discard-untrimmed 把reads中不含有ada ......
  • miRNAreads过滤数据adsbygoogle

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