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RNA_seq 热图绘制
若已经拿到表达矩阵
exprSet
若差异较大,进行log缩小不同样本的差距 1 加载包 2 library(pheatmap) 3 4 缩小表达量差距 5
exprSet
<- log2(
exprSet
+1) ......
热图
pheatmap
绘制
rlog
exprSet
RNA-seq 生物学重复相关性验证
根据拿到的表达矩阵设为
exprSet
数据中心化:数据集中的各个数字减去数据集的均值 数据标准化:中心化之后的数据在除以数据集的标准差。 在R中利用scale方法来对数 ......
RNA
exprSet
seq
scale
基因
2018年SCI论文--整合GEO数据挖掘完整复现 二 :差异表达(GSE13507)
文章目录 论文地址GSE13507数据下载到表达矩阵GSE13507数据下载getGEO包下载的探针注释文件不全,需要在GEO网站下载筛选探针分位数标准化预处理分组 差异表达 ......
数据挖掘
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GEO
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