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MindSponge分子动力学模拟——安装与使用(2023.08)
技术背景 昇思MindSpore是由华为主导的一个,面向全场景构建最佳昇腾匹配、支持多处理器架构的开放AI框架。MindSpore不仅仅是软件层面的工具,更重要的是可以协同华 ......
dechin
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rw
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MindSponge
在Python中使用LooseVersion进行软件版本号比对
技术背景 Python是一门极其热门、极其灵活的开发语言,其更新迭代的速度也非常的快速。有时候我们遇到不同的软件版本不同方法处理的情况,此时就需要用到版本号比对 ......
LooseVersion
版本号
Python
python
1.21.6
在Linux系统下限制指定目录的大小以及文件/文件夹数量
背景说明 在Linux操作系统下有时需要限制一个指定文件夹的大小和文件夹内可存储的文件数量,有可能是出于安全的考量或者定制化的配置,这里我们提供了一种方案:用d ......
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manjaro
dir
Latex中也能展示动态图?
技术背景 在学术领域,很多文档是用Latex做的,甚至有很多人用Latex Beamer来做PPT演示文稿。虽然在易用性和美观等角度来说,Latex Beamer很大程度上不如PowerPoint, ......
dechin
png
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Sep
在VMD上可视化hdf5格式的分子轨迹文件
技术背景 在处理分子动力学模拟的数据时,不可避免的会遇到众多的大轨迹文件。因此以什么样的格式来存储这些庞大的轨迹数据,也是一个在分子动力学模拟软件设计初期 ......
dechin
格式
VMD
rw
hdf5
RMarkdown进阶操作
技术背景 Markdown大家都比较熟悉了,特别是在写程序文档和写数学公式时,拥有着无与伦比的便利性。同时在前面的一篇博客中我们介绍了使用RMarkdown去写Latex Beame ......
进阶
操作
RMarkdown
Latex
https
Open Babel的安装与使用
技术背景 Open Babel是化学领域常用的一个文件格式转换工具,它可以支持xyz的坐标格式、SMILES表达式、InChI表达式和mol以及mol2等格式之间的互相转化。比如说,你只 ......
openbabel
安装
dechin
Babel
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python3使用pycuda执行简单GPU计算任务
技术背景 GPU的加速技术在深度学习、量子计算领域都已经被广泛的应用。其适用的计算模型是小内存的密集型计算场景,如果计算的模型内存较大,则需要使用到共享内存, ......
GPU
pycuda
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计算
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用tqdm和rich为固定路径和目标的python算法代码实现进度条
适用场景 在存在固定长度的算法中可以可视化算法执行的过程,比如对一个固定长度的数组的遍历,就是一种适合使用进度条来进行可视化的场景。而一些条件循环,比如whi ......
tqdm
进度条
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00
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python3存储numpy格式的矩阵
技术背景 numpy在python中的地位是相当高的,即使是入门的python使用者也会经常看到这个库的使用。除了替代python自带的列表数据格式list之外,numpy的一大优势是其 ......
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