Bioconductor 中的 R 包安装教程
Bioconductor 是一个基于 R 语言的生物信息软件包，主要用于生物数据的注释、分析、统计、以及可视化(http://www.bioconductor.org)。 总所周知，Bioconductor 是和 R ......![]()
R语言|ggplot2| 绘制KEGG气泡图
在 RStudio 中使用 BiocManager 安装包 install.packages("BiocManager") install.packages("ggplot2") 安装对应版本的 Rtools 详细指导说明 安装连接 安装完成 ......![]()
maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot（瀑布图）
本文首发于微信公众号 **“ 生信补给站 ”** ，期待您的关注！！！ 原文链接：https://mp.weixin.qq.com/s/G-0PtaoO6bYuhx_D_Rlrlw 对于组学数据的分析和展示来说，mafto ......![]()
Linux一些错误总结
1、cannot verify <mydomainname> certificate, issued by ‘/C=US/O=Let’s Encrypt/CN=R3’: 解决1：wget --no-check-certificate <website> //再运行一遍 解决2：s ......![]()
R包对植物进行GO，KEGG注释
1、安装，加载所用到到R包 用BiocManager安装，可同时加载依赖包 source("https://bioconductor.org/biocLite.R") BiocManager::install("clusterProfiler") librar ......![]()
Linux环境下R和R包安装及其管理
R对windows使用很友好，对Linux来说充满了敌意。小数据可以在windows下交互操作，效果很好很棒。可是当我们要处理大数据，或者要在集群上搭建pipeline时，不得不面对在 ......org.Hs.eg.db
bioconduction 主页 http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/html/org.Hs.eg.db.html 安装 if (!requireNamespace("BiocManager", quie ......![]()
【R】clusterProfiler的GO/KEGG富集分析用法小结
前言 关于clusterProfiler这个R包就不介绍了，网红教授宣传得很成功，功能也比较强大，主要是做GO和KEGG的功能富集及其可视化。简单总结下用法，以后用时可直接找来用 ......Affy包 estrogen包
下载安装 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("affy") BiocManager::install( ......![]()
INVERSION包
1、安装该包 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))install.packages("BiocManager") BiocManager::install('inveRsion')...
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