OFRecord 数据格式
阅读原文时间:2023年07月09日阅读:1

OFRecord 数据格式

深度学习应用需要复杂的多阶段数据预处理流水线,数据加载是流水线的第一步,OneFlow 支持多种格式数据的加载,其中 OFRecord 格式是 OneFlow 原生的数据格式。

OFRecord 的格式定义参考了 TensorFlow 的 TFRecord,熟悉 TFRecord 的用户,可以很快上手 OneFlow 的 OFRecord。

本文将介绍:

  • OFRecord 使用的数据类型
  • 如何将数据转化为 OFRecord 对象并序列化
  • OFRecord 文件格式

有助于学习加载与准备 OFRecord 数据集

OFRecord 相关数据类型

OneFlow 内部采用Protocol Buffers 描述 OFRecord 的序列化格式。相关的 .proto 文件在 oneflow/core/record/record.proto 中,具体定义如下:

syntax = "proto2";

package oneflow;

message BytesList {

repeated bytes value = 1;

}

message FloatList {

repeated float value = 1 [packed = true];

}

message DoubleList {

repeated double value = 1 [packed = true];

}

message Int32List {

repeated int32 value = 1 [packed = true];

}

message Int64List {

repeated int64 value = 1 [packed = true];

}

message Feature {

oneof kind {

BytesList bytes_list = 1;

FloatList float_list = 2;

DoubleList double_list = 3;

Int32List int32_list = 4;

Int64List int64_list = 5;

}

}

message OFRecord {

map feature = 1;

}

先对以上的重要数据类型进行解释:

  • OFRecord: OFRecord 的实例化对象,可用于存储所有需要序列化的数据。它由任意多个 string->Feature 的键值对组成;
  • Feature: Feature 可存储 BytesList、FloatList、DoubleList、Int32List、Int64List 各类型中的任意一种;
  • OFRecord、Feature、XXXList 等类型,均由 Protocol Buffers 生成对应的同名接口,使得可以在 Python 层面构造对应对象。

转化数据为 Feature 格式

可以通过调用 ofrecord.xxxList 及 ofrecord.Feature 将数据转为 Feature 格式,为了更加方便,需要对 protocol buffers 生成的接口进行简单封装:

import oneflow.core.record.record_pb2 as ofrecord

def int32_feature(value):

if not isinstance(value, (list, tuple)):

value = [value]

return ofrecord.Feature(int32_list=ofrecord.Int32List(value=value))

def int64_feature(value):

if not isinstance(value, (list, tuple)):

value = [value]

return ofrecord.Feature(int64_list=ofrecord.Int64List(value=value))

def float_feature(value):

if not isinstance(value, (list, tuple)):

value = [value]

return ofrecord.Feature(float_list=ofrecord.FloatList(value=value))

def double_feature(value):

if not isinstance(value, (list, tuple)):

value = [value]

return ofrecord.Feature(double_list=ofrecord.DoubleList(value=value))

def bytes_feature(value):

if not isinstance(value, (list, tuple)):

value = [value]

if not six.PY2:

if isinstance(value[0], str):

value = [x.encode() for x in value]

return ofrecord.Feature(bytes_list=ofrecord.BytesList(value=value))

创建 OFRecord 对象并序列化

在下例子中,将创建有2个 feature 的 OFRecord 对象,并且调用它的 SerializeToString 方法序列化。

obserations = 28 * 28

f = open("./dataset/part-0", "wb")

for loop in range(0, 3):

image = [random.random() for x in range(0, obserations)]

label = [random.randint(0, 9)]

topack = {

"images": float_feature(image),

"labels": int64_feature(label),

}

ofrecord_features = ofrecord.OFRecord(feature=topack)

serilizedBytes = ofrecord_features.SerializeToString()

通过以上例子,可以总结序列化数据的步骤:

  • 将需要序列化的数据,通过调用 ofrecord.Feature 及 ofrecord.XXXList 转为 Feature 对象;
  • 将上一步得到的各个 Feature 对象,以 string->Feature 键值对的形式,存放在 Python 字典中;
  • 调用 ofrecord.OFRecord 创建 OFRecord 对象
  • 调用 OFRecord 对象的 SerializeToString 方法得到序列化结果

序列化的结果,可以存为 ofrecord 格式的文件。

OFRecord 格式的文件

将 OFRecord 对象序列化后按 OneFlow 约定的格式存文件,就得到 OFRecord文件 。

1个 OFRecord 文件中可存储多个 OFRecord 对象,OFRecord 文件可用于 OneFlow 数据流水线,具体操作可见加载与准备 OFRecord 数据集

OneFlow 约定,对于 每个 OFRecord 对象,用以下格式存储:

uint64 length

byte   data[length]

即头8个字节存入数据长度,然后存入序列化数据本身。

length = ofrecord_features.ByteSize()

f.write(struct.pack("q", length))

f.write(serilizedBytes)

代码

以下完整代码展示如何生成 OFRecord 文件,并调用 protobuf 生成的 OFRecord 接口手工读取 OFRecord 文件中的数据。

实际上,OneFlow 提供了 flow.data.decode_ofrecord 等接口,可以更方便地提取 OFRecord 文件(数据集)中的内容。详细内容请参见加载与准备 OFRecord 数据集

将 OFRecord 对象写入文件

以下脚本,模拟了3个样本,每个样本为28*28的图片,并且包含对应标签。将三个样本转化为 OFRecord 对象后,按照 OneFlow 约定格式,存入文件。

代码:ofrecord_to_string.py

从 OFRecord 文件中读取数据

以下脚本,读取上例中生成的 OFRecord 文件,调用 FromString 方法反序列化得到 OFRecord 对象,并最终显示数据:

代码:ofrecord_from_string.py