Galaxy 生信平台(四)：邮件与管理员配置

阅读原文时间：2023年07月26日阅读：2

前几天看到中山大学和国家基因库合作开发的 Translatome Workbench 翻译组学可视化在线数据分析平台 (db.cngb.org/galaxy/) 的推送信息，也上去看了一下，工具和教程都做的非常用心，这也算是国内为数不多的 Galaxy 研究中的一抹亮色了。

本文章作为 Galaxy 生信平台的第四篇，继续来带大家学习了解一下这个开源平台，希望大家有所收获。

我在《QQ 邮箱设置自定义域名邮箱》中给大家展示了，如何通过自己申请的域名+ QQ 邮箱打造一个高端大气的个人专业邮箱。今天来了一下如何把自定义的 QQ 域名邮箱应用到 Galaxy 生信分析平台中。

Galaxy Project 是一个基于云计算背景下的开源生物信息分析项目，而 Galaxy 平台则是这个项目的集大成者。作为一个用于生产环境中，可以满足多用户使用的在线平台，Galaxy 的邮箱服务可谓是至关重要，尤其对于普通用户常见的登录限制、注册激活、密码重置与修改找回、页面错误报告等琐碎问题的处理上，它可以大大减轻系统管理员的工作量。

Galaxy 收发邮件的核心代码主要位于以下两个程序，其核心模块则是 util.send_mail，一个基于 email 和 smtplib 库进行封装的函数，具体源码，感兴趣的可以去研究一下。

lib/galaxy/util/**init**.py
lib/galaxy/managers/users.py
lib/galaxy/webapps/galaxy/controllers/user.py

所以，在设置 Galaxy 邮箱服务前，我们先来了解一下如何在 Python 中基于 email 和 smtplib 库进行 QQ 邮件的发送。

首先我们要知道用 python 代理登录 qq 邮箱发邮件，是需要更改自己 qq 邮箱设置的。在这里大家需要做两件事情：邮箱开启 SMTP 功能、获得授权码，步骤如下。

首先，在打开的 QQ 邮箱中，进入"设置"。

第二，在邮箱设置界面，打开
“帐户”。

第三，往下找到 POP3/IMAP/… 服务，点击 POP3/SMTP 所在行，右侧的
“开启”。

如果是第一次开启 POP3/SMTP 这时系统会要求通过密保手机发送一条特别内容的短信，待手机上短信发送完成后，点击
“我已发送”。

这样就可以得到 POP3/SMTP 服务的授权码了。

回到上页，可以看到 POP3/SMTP 服务已经处于开启状态。同样的，如果忘记了授权码，可以点击温馨提示中"生成授权码"的链接重新再次生成。

SMTP 服务和授权码都有了，接下来我们要基于 python3 的
email和
smtplib 库实现一个简单的发邮件功能。

from&nbsp;email.mime.text&nbsp;import&nbsp;MIMETextfrom&nbsp;email.header&nbsp;import&nbsp;Headerfrom&nbsp;smtplib&nbsp;import&nbsp;SMTP_SSL#qq&nbsp;邮箱&nbsp;smtp&nbsp;服务器host_server&nbsp;=&nbsp;'smtp.qq.com'#sender_login&nbsp;为发件人的域名邮箱(或者&nbsp;QQ&nbsp;号码)sender_login&nbsp;=&nbsp;'shenweiyan@bioitee.com'#pwd&nbsp;为&nbsp;qq&nbsp;域名邮箱的授权码pwd&nbsp;=&nbsp;'r***h***b'#发件人的邮箱sender_mail&nbsp;=&nbsp;'shenweiyan@bioitee.com'#收件人邮箱receiver_mail&nbsp;=&nbsp;'ishenweiyan@gmail.com'#邮件的正文内容mail_content&nbsp;=&nbsp;'你好，我是沈维燕，现在在进行一项用&nbsp;python&nbsp;登录&nbsp;qq&nbsp;邮箱发邮件的测试'#邮件标题mail_title&nbsp;=&nbsp;'沈维燕的邮件'#ssl登录smtp&nbsp;=&nbsp;SMTP_SSL(host_server)#set_debuglevel()&nbsp;是用来调试的。参数值为 1 表示开启调试模式，参数值为&nbsp;0&nbsp;关闭调试模式smtp.set_debuglevel(1)smtp.ehlo(host_server)smtp.login(sender_login,&nbsp;pwd)msg&nbsp;=&nbsp;MIMEText(mail_content,&nbsp;"plain",&nbsp;'utf-8')msg["Subject"]&nbsp;=&nbsp;Header(mail_title,&nbsp;'utf-8')msg["From"]&nbsp;=&nbsp;sender_mailmsg["To"]&nbsp;=&nbsp;receiver_mailsmtp.sendmail(sender_mail,&nbsp;receiver,&nbsp;msg.as_string())smtp.quit()

有了上一步 python 发送邮件的经验，接下来我们只需要修改一下 Galaxy 的主配置文件
config/galaxy.yml 即可：

galaxy:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;smtp_server:&nbsp;'smtp.qq.com'&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;smtp_username:&nbsp;'shenweiyan@bioitee.com'&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;smtp_password:&nbsp;'h**z***j'&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;smtp_ssl:&nbsp;true&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;error_email_to:&nbsp;'shenweiyan@bioitee.com'&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;email_from:&nbsp;'shenweiyan@bioitee.com'

配置完成后，重启 Galaxy 服务。

如果你只想把你个人部署的 Galaxy 提供给特定的人使用，例如同一个实验室的其他小伙伴，你可以把 Galaxy 的注册功能关闭，并设置只能通过管理员创建新账号。

galaxy:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;#&nbsp;设置&nbsp;Galaxy&nbsp;管理员账号，如有多个管理员，请用逗号分隔&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;admin_users:&nbsp;'shenweiyan@bioitee.com'&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;#&nbsp;强制所有用户均需要注册登录才能使用&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;require_login:&nbsp;false&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;#&nbsp;开启用户激活功能(如果设置为"false"，则帐户自注册以来一直处于活动状态)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;user_activation_on:&nbsp;true&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;#&nbsp;设置激活有效时长(小时)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;activation_grace_period:&nbsp;3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;#&nbsp;允许未注册的用户创建新帐户(否则，必须由管理员创建)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;allow_user_creation:&nbsp;false&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;#&nbsp;允许管理员删除已经注册的账号&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;allow_user_deletion:&nbsp;true&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;#&nbsp;允许管理员模拟其他用户登录，进行问题追踪&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;allow_user_impersonation:&nbsp;true

配置好了 Galaxy 邮箱服务，我们来测试一下注册激活验证和重置密码。

Galaxy 在账号未激活状态下，登录后的界面

Galaxy 用户注册，通过邮箱实现账号激活

通过邮箱实现 Galaxy 用户密码修改

到这里，Galaxy 的邮件服务和管理员设置就完成了，如果想要更改 Galaxy 默认的邮件内容（例如把英文改成中文，或者增删邮件发送内容），可以仔细去研究一下它的源码，也欢迎留言或者添加作者微信交流。最后总结一句，就是，QQ 域名邮箱的本质还是 QQ 邮箱，因此，它收发邮箱的服务器设置依然是 qq.com，不管您最终选择 QQ 邮箱还是 QQ 域名邮箱，它们的配置原理都是一样。

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